Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc110Q3V125 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms