Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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Dnah12Q3V0Q1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Dnah12Q3V0Q1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Dnah12Q3V0Q1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Dnah12Q3V0Q1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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Dnah12Q3V0Q1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnah12Q3V0Q1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms