Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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