Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Garnl3Q3V0G7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Garnl3Q3V0G7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms