Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clpsl2Q3UW21 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms