Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn4Q3UV66 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms