Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc190Q3URK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc190Q3URK1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms