Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Elf3Q3UPW2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Elf3Q3UPW2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms