Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgef40Q3UPH7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms