Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UPC7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms