Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc4Q3UP44 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms