Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrc4Q3UP24 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrc4Q3UP24 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms