Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms