Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp19Q3UJD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms