Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms