Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm648Q3UJ22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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