Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arfgef3Q3UGY8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms