Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph3aQ3UFY4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms