Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms