Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Yipf3Q3UDR8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Yipf3Q3UDR8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms