Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttll12Q3UDE2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttll12Q3UDE2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms