Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3U7U4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U7U4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms