Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms