Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gse1Q3U3C9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms