Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vars2Q3U2A8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vars2Q3U2A8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms