Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serac1Q3U213 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms