Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U1D9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U1D9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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