Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms