Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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