Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3TTL0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3TTL0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms