Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TTJ4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q3TTJ4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms