Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CiartQ3TQ03 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms