Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc102aQ3TMW1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms