Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL09

G430049J08Rik, RIKEN cDNA G430049J08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G430049J08RikQ3TL09 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
G430049J08RikQ3TL09 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
G430049J08RikQ3TL09 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms