Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc13Q3TIR1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc13Q3TIR1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms