Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hp1bp3Q3TEA8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms