Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc69Q3TCJ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms