Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prr27Q3SYJ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prr27Q3SYJ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms