Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Treml4Q3LRV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml4Q3LRV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms