Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riiad1Q3KNY5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riiad1Q3KNY5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms