Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3KNL4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3KNL4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms