Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defb33Q30KN3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defb33Q30KN3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb33Q30KN3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Defb33Q30KN3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb33Q30KN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Defb33Q30KN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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