Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm1Q2TV84 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm1Q2TV84 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms