Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms