Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam178bQ24JP3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam178bQ24JP3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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