Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpne9Q1RLL3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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