Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim71Q1PSW8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms