Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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ptchd1Q14B62 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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ptchd1Q14B62 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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