Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lingo4Q149C3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Lingo4Q149C3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lingo4Q149C3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lingo4Q149C3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lingo4Q149C3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Lingo4Q149C3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms