Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Perm1Q149B8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Perm1Q149B8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Perm1Q149B8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms